Institute of Bioanalytical Chemistry
Prof. Dr. Norbert Sträter
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| Center
for Biotechnology and Biomedicine Institute of Bioanalytical Chemistry |
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Structural
analysis of biopolymers Prof. Dr. Norbert Sträter |
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Lehrveranstaltungen / ClassesBachelorarbeiten Wintersemester Chemie für Mediziner (4 SWS) Experimentalvorlesung Chemie für Mediziner Protein Crystallography / Proteinkristallographie in English language
Mittels der Methode der Röntgenkristallographie können die Raumstrukturen von organischen Molekülen, anorganischen Festkörpern sowie von biologischen Makromolekülen zu atomarer Auflösung bestimmt werden. In der Vorlesung werden die für Naturwissenschaftler relevanten Grundlagen dieser Methoden praxisnah vermittelt. Es werden u.a. die folgenden Themen behandelt. Der Schwerpunkt liegt auf der Biokristallographie. Kristallisation Kristalle, Symmetrie und Raumgruppen Röntgenquellen und Detektoren Datensammlung Beugung von Röntgenstrahlen und Neutronen Phasenproblem, Phasierung und Phasenverfeinerung Strukturlösung von niedermolekularen Verbindungen mittels Pattersonfunktion und direkte Methoden Strukturlösung von Biomolekülen mittels molekularem Ersatz, Schweratomersatz und anomaler Dispersion Modellbau und Strukturvisualisierung Strukturverfeinerung -> weitere Informationen Kurzpraktikum Proteinstrukturanalyse für Biochemiker im Rahmen des Praktikums Biophysikalische Chemie (Prof. Hofmann, Biochemie). 4 Teilnehmer pro Gruppe Leitung: B. Küttner (97-31314) Kristallisation - Datensammlung - Modellbau Sommersemester Vorlesung Strukturelle Biochemie im Modul "Strukturelle und Anorganische Biochemie" Grundlagen und Methoden der Strukturchemie (hier 3D-Struktur) biologischer Moleküle für Chemiker, Biochemiker, Biologen und andere interessierte Naturwissenschaftler. Die Funktionsweise eines Proteins kann nur auf der Grundlage seiner Raumstruktur verstanden werden. Durch Fortschritte auf den Gebieten der Molekularbiologie, Proteinreinigung und der Methoden der Proteinkristallographie und NMR-Strukturbestimmung stehen die Raumstrukturen von immer mehr Proteinen zur Verfügung. Aktuelle Projekte zur Hochdurchsatz-Strukturbestimmung zahlreicher Proteine, z.B. aller humanen Proteine im Anschluß an die Genomsequenzierung, erhöhen die Zahl neu bestimmter Proteinstrukturen weiter. Es ist notwendig, dass Biochemiker, Chemiker, Biologen, Physiker, Mediziner diese Strukturinformation durch für die eigene Forschung zu nutzen wissen, z.B. für - Interpretation funktioneller Daten mit Hilfe der Raumstruktur - Homologie-Modellierung (Struktur eines ähnlichen Proteins ist bekannt) - Protein-Design - Strukturbasierte Wirkstoffentwicklung - Enzyme in der organischen Synthese Inhalt der Vorlesung : Strukturchemie von Proteinen Visualisierung von Proteinstrukturen charakteristische Faltungstypen Methoden zur Bestimmung von Raumstrukturen Protein-Datenbank Wechselwirkungen: Protein-Ligand, Protein-Protein, Faltung Strukturbasierte Wirkstoffentwicklung Auswertung von Proteinstrukturen Kraftfelder und Molekülmodellierung Homologie-Modellierung Struktur und Funktion: ausgewählte Beispiele Flexibilität in Proteinen, Konformationsänderungen Proteinfaltung Evolution von Proteinen |